]> git.karo-electronics.de Git - karo-tx-linux.git/commitdiff
MIPS: Octeon: Add support for OCTEON II PCIe
authorDavid Daney <david.daney@cavium.com>
Tue, 22 Nov 2011 14:47:04 +0000 (14:47 +0000)
committerRalf Baechle <ralf@linux-mips.org>
Tue, 22 Nov 2011 14:47:04 +0000 (14:47 +0000)
OCTEON II SOCs have a different PCIe implementation than is present in
OCTEON Plus.

Signed-off-by: David Daney <david.daney@cavium.com>
Cc: linux-mips@linux-mips.org
Patchwork: https://patchwork.linux-mips.org/patch/2985/
Signed-off-by: Ralf Baechle <ralf@linux-mips.org>
arch/mips/pci/pcie-octeon.c

index 0583c463e5f19137b794b2772910ad5b904e98d8..fdb4d558c0cc0d0b40332d6e38b37c33bc8a3169 100644 (file)
@@ -3,7 +3,7 @@
  * License.  See the file "COPYING" in the main directory of this archive
  * for more details.
  *
- * Copyright (C) 2007, 2008 Cavium Networks
+ * Copyright (C) 2007, 2008, 2009, 2010, 2011 Cavium Networks
  */
 #include <linux/kernel.h>
 #include <linux/init.h>
 #include <linux/interrupt.h>
 #include <linux/time.h>
 #include <linux/delay.h>
+#include <linux/module.h>
 
 #include <asm/octeon/octeon.h>
 #include <asm/octeon/cvmx-npei-defs.h>
 #include <asm/octeon/cvmx-pciercx-defs.h>
 #include <asm/octeon/cvmx-pescx-defs.h>
 #include <asm/octeon/cvmx-pexp-defs.h>
+#include <asm/octeon/cvmx-pemx-defs.h>
+#include <asm/octeon/cvmx-dpi-defs.h>
+#include <asm/octeon/cvmx-sli-defs.h>
+#include <asm/octeon/cvmx-sriox-defs.h>
 #include <asm/octeon/cvmx-helper-errata.h>
 #include <asm/octeon/pci-octeon.h>
 
+#define MRRS_CN5XXX 0 /* 128 byte Max Read Request Size */
+#define MPS_CN5XXX  0 /* 128 byte Max Packet Size (Limit of most PCs) */
+#define MRRS_CN6XXX 3 /* 1024 byte Max Read Request Size */
+#define MPS_CN6XXX  0 /* 128 byte Max Packet Size (Limit of most PCs) */
+
+/* Module parameter to disable PCI probing */
+static int pcie_disable;
+module_param(pcie_disable, int, S_IRUGO);
+
+static int enable_pcie_14459_war;
+static int enable_pcie_bus_num_war[2];
+
 union cvmx_pcie_address {
        uint64_t u64;
        struct {
@@ -75,6 +92,8 @@ union cvmx_pcie_address {
        } mem;
 };
 
+static int cvmx_pcie_rc_initialize(int pcie_port);
+
 #include <dma-coherence.h>
 
 /**
@@ -154,12 +173,21 @@ static inline uint64_t cvmx_pcie_get_mem_size(int pcie_port)
  */
 static uint32_t cvmx_pcie_cfgx_read(int pcie_port, uint32_t cfg_offset)
 {
-       union cvmx_pescx_cfg_rd pescx_cfg_rd;
-       pescx_cfg_rd.u64 = 0;
-       pescx_cfg_rd.s.addr = cfg_offset;
-       cvmx_write_csr(CVMX_PESCX_CFG_RD(pcie_port), pescx_cfg_rd.u64);
-       pescx_cfg_rd.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_PESCX_CFG_RD(pcie_port));
-       return pescx_cfg_rd.s.data;
+       if (octeon_has_feature(OCTEON_FEATURE_NPEI)) {
+               union cvmx_pescx_cfg_rd pescx_cfg_rd;
+               pescx_cfg_rd.u64 = 0;
+               pescx_cfg_rd.s.addr = cfg_offset;
+               cvmx_write_csr(CVMX_PESCX_CFG_RD(pcie_port), pescx_cfg_rd.u64);
+               pescx_cfg_rd.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_PESCX_CFG_RD(pcie_port));
+               return pescx_cfg_rd.s.data;
+       } else {
+               union cvmx_pemx_cfg_rd pemx_cfg_rd;
+               pemx_cfg_rd.u64 = 0;
+               pemx_cfg_rd.s.addr = cfg_offset;
+               cvmx_write_csr(CVMX_PEMX_CFG_RD(pcie_port), pemx_cfg_rd.u64);
+               pemx_cfg_rd.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_PEMX_CFG_RD(pcie_port));
+               return pemx_cfg_rd.s.data;
+       }
 }
 
 /**
@@ -173,11 +201,19 @@ static uint32_t cvmx_pcie_cfgx_read(int pcie_port, uint32_t cfg_offset)
 static void cvmx_pcie_cfgx_write(int pcie_port, uint32_t cfg_offset,
                                 uint32_t val)
 {
-       union cvmx_pescx_cfg_wr pescx_cfg_wr;
-       pescx_cfg_wr.u64 = 0;
-       pescx_cfg_wr.s.addr = cfg_offset;
-       pescx_cfg_wr.s.data = val;
-       cvmx_write_csr(CVMX_PESCX_CFG_WR(pcie_port), pescx_cfg_wr.u64);
+       if (octeon_has_feature(OCTEON_FEATURE_NPEI)) {
+               union cvmx_pescx_cfg_wr pescx_cfg_wr;
+               pescx_cfg_wr.u64 = 0;
+               pescx_cfg_wr.s.addr = cfg_offset;
+               pescx_cfg_wr.s.data = val;
+               cvmx_write_csr(CVMX_PESCX_CFG_WR(pcie_port), pescx_cfg_wr.u64);
+       } else {
+               union cvmx_pemx_cfg_wr pemx_cfg_wr;
+               pemx_cfg_wr.u64 = 0;
+               pemx_cfg_wr.s.addr = cfg_offset;
+               pemx_cfg_wr.s.data = val;
+               cvmx_write_csr(CVMX_PEMX_CFG_WR(pcie_port), pemx_cfg_wr.u64);
+       }
 }
 
 /**
@@ -348,7 +384,6 @@ static void cvmx_pcie_config_write32(int pcie_port, int bus, int dev, int fn,
 static void __cvmx_pcie_rc_initialize_config_space(int pcie_port)
 {
        union cvmx_pciercx_cfg030 pciercx_cfg030;
-       union cvmx_npei_ctl_status2 npei_ctl_status2;
        union cvmx_pciercx_cfg070 pciercx_cfg070;
        union cvmx_pciercx_cfg001 pciercx_cfg001;
        union cvmx_pciercx_cfg032 pciercx_cfg032;
@@ -365,21 +400,21 @@ static void __cvmx_pcie_rc_initialize_config_space(int pcie_port)
        /* Max Read Request Size (PCIE*_CFG030[MRRS]) */
        /* Relaxed-order, no-snoop enables (PCIE*_CFG030[RO_EN,NS_EN] */
        /* Error Message Enables (PCIE*_CFG030[CE_EN,NFE_EN,FE_EN,UR_EN]) */
-       pciercx_cfg030.u32 =
-               cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG030(pcie_port));
-       /*
-        * Max payload size = 128 bytes for best Octeon DMA
-        * performance.
-        */
-       pciercx_cfg030.s.mps = 0;
+
+       pciercx_cfg030.u32 = cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG030(pcie_port));
+       if (OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN5XXX)) {
+               pciercx_cfg030.s.mps = MPS_CN5XXX;
+               pciercx_cfg030.s.mrrs = MRRS_CN5XXX;
+       } else {
+               pciercx_cfg030.s.mps = MPS_CN6XXX;
+               pciercx_cfg030.s.mrrs = MRRS_CN6XXX;
+       }
        /*
-        * Max read request size = 128 bytes for best Octeon DMA
-        * performance.
+        * Enable relaxed order processing. This will allow devices to
+        * affect read response ordering.
         */
-       pciercx_cfg030.s.mrrs = 0;
-       /* Enable relaxed ordering. */
        pciercx_cfg030.s.ro_en = 1;
-       /* Enable no snoop. */
+       /* Enable no snoop processing. Not used by Octeon */
        pciercx_cfg030.s.ns_en = 1;
        /* Correctable error reporting enable. */
        pciercx_cfg030.s.ce_en = 1;
@@ -389,50 +424,67 @@ static void __cvmx_pcie_rc_initialize_config_space(int pcie_port)
        pciercx_cfg030.s.fe_en = 1;
        /* Unsupported request reporting enable. */
        pciercx_cfg030.s.ur_en = 1;
-       cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG030(pcie_port),
-                            pciercx_cfg030.u32);
+       cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG030(pcie_port), pciercx_cfg030.u32);
 
-       /*
-        * Max Payload Size (NPEI_CTL_STATUS2[MPS]) must match
-        * PCIE*_CFG030[MPS]
-        *
-        * Max Read Request Size (NPEI_CTL_STATUS2[MRRS]) must not
-        * exceed PCIE*_CFG030[MRRS].
-        */
-       npei_ctl_status2.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_PEXP_NPEI_CTL_STATUS2);
-       /* Max payload size = 128 bytes for best Octeon DMA performance */
-       npei_ctl_status2.s.mps = 0;
-       /* Max read request size = 128 bytes for best Octeon DMA performance */
-       npei_ctl_status2.s.mrrs = 0;
-       if (pcie_port)
-               npei_ctl_status2.s.c1_b1_s = 3; /* Port1 BAR1 Size 256MB */
-       else
-               npei_ctl_status2.s.c0_b1_s = 3; /* Port0 BAR1 Size 256MB */
-       cvmx_write_csr(CVMX_PEXP_NPEI_CTL_STATUS2, npei_ctl_status2.u64);
+
+       if (octeon_has_feature(OCTEON_FEATURE_NPEI)) {
+               union cvmx_npei_ctl_status2 npei_ctl_status2;
+               /*
+                * Max Payload Size (NPEI_CTL_STATUS2[MPS]) must match
+                * PCIE*_CFG030[MPS].  Max Read Request Size
+                * (NPEI_CTL_STATUS2[MRRS]) must not exceed
+                * PCIE*_CFG030[MRRS]
+                */
+               npei_ctl_status2.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_PEXP_NPEI_CTL_STATUS2);
+               /* Max payload size = 128 bytes for best Octeon DMA performance */
+               npei_ctl_status2.s.mps = MPS_CN5XXX;
+               /* Max read request size = 128 bytes for best Octeon DMA performance */
+               npei_ctl_status2.s.mrrs = MRRS_CN5XXX;
+               if (pcie_port)
+                       npei_ctl_status2.s.c1_b1_s = 3; /* Port1 BAR1 Size 256MB */
+               else
+                       npei_ctl_status2.s.c0_b1_s = 3; /* Port0 BAR1 Size 256MB */
+
+               cvmx_write_csr(CVMX_PEXP_NPEI_CTL_STATUS2, npei_ctl_status2.u64);
+       } else {
+               /*
+                * Max Payload Size (DPI_SLI_PRTX_CFG[MPS]) must match
+                * PCIE*_CFG030[MPS].  Max Read Request Size
+                * (DPI_SLI_PRTX_CFG[MRRS]) must not exceed
+                * PCIE*_CFG030[MRRS].
+                */
+               union cvmx_dpi_sli_prtx_cfg prt_cfg;
+               union cvmx_sli_s2m_portx_ctl sli_s2m_portx_ctl;
+               prt_cfg.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_DPI_SLI_PRTX_CFG(pcie_port));
+               prt_cfg.s.mps = MPS_CN6XXX;
+               prt_cfg.s.mrrs = MRRS_CN6XXX;
+               /* Max outstanding load request. */
+               prt_cfg.s.molr = 32;
+               cvmx_write_csr(CVMX_DPI_SLI_PRTX_CFG(pcie_port), prt_cfg.u64);
+
+               sli_s2m_portx_ctl.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_PEXP_SLI_S2M_PORTX_CTL(pcie_port));
+               sli_s2m_portx_ctl.s.mrrs = MRRS_CN6XXX;
+               cvmx_write_csr(CVMX_PEXP_SLI_S2M_PORTX_CTL(pcie_port), sli_s2m_portx_ctl.u64);
+       }
 
        /* ECRC Generation (PCIE*_CFG070[GE,CE]) */
-       pciercx_cfg070.u32 =
-               cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG070(pcie_port));
+       pciercx_cfg070.u32 = cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG070(pcie_port));
        pciercx_cfg070.s.ge = 1;        /* ECRC generation enable. */
        pciercx_cfg070.s.ce = 1;        /* ECRC check enable. */
-       cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG070(pcie_port),
-                            pciercx_cfg070.u32);
+       cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG070(pcie_port), pciercx_cfg070.u32);
 
        /*
-        * Access Enables (PCIE*_CFG001[MSAE,ME]) ME and MSAE should
-        * always be set.
-        *
-        * Interrupt Disable (PCIE*_CFG001[I_DIS]) System Error
-        * Message Enable (PCIE*_CFG001[SEE])
+        * Access Enables (PCIE*_CFG001[MSAE,ME])
+        * ME and MSAE should always be set.
+        * Interrupt Disable (PCIE*_CFG001[I_DIS])
+        * System Error Message Enable (PCIE*_CFG001[SEE])
         */
-       pciercx_cfg001.u32 =
-               cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG001(pcie_port));
+       pciercx_cfg001.u32 = cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG001(pcie_port));
        pciercx_cfg001.s.msae = 1;      /* Memory space enable. */
        pciercx_cfg001.s.me = 1;        /* Bus master enable. */
        pciercx_cfg001.s.i_dis = 1;     /* INTx assertion disable. */
        pciercx_cfg001.s.see = 1;       /* SERR# enable */
-       cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG001(pcie_port),
-                       pciercx_cfg001.u32);
+       cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG001(pcie_port), pciercx_cfg001.u32);
 
        /* Advanced Error Recovery Message Enables */
        /* (PCIE*_CFG066,PCIE*_CFG067,PCIE*_CFG069) */
@@ -440,14 +492,11 @@ static void __cvmx_pcie_rc_initialize_config_space(int pcie_port)
        /* Use CVMX_PCIERCX_CFG067 hardware default */
        cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG069(pcie_port), 0);
 
-       /* Active State Power Management (PCIE*_CFG032[ASLPC]) */
-       pciercx_cfg032.u32 =
-               cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG032(pcie_port));
-       pciercx_cfg032.s.aslpc = 0;     /* Active state Link PM control. */
-       cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG032(pcie_port),
-                            pciercx_cfg032.u32);
 
-       /* Entrance Latencies (PCIE*_CFG451[L0EL,L1EL]) */
+       /* Active State Power Management (PCIE*_CFG032[ASLPC]) */
+       pciercx_cfg032.u32 = cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG032(pcie_port));
+       pciercx_cfg032.s.aslpc = 0; /* Active state Link PM control. */
+       cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG032(pcie_port), pciercx_cfg032.u32);
 
        /*
         * Link Width Mode (PCIERCn_CFG452[LME]) - Set during
@@ -462,8 +511,8 @@ static void __cvmx_pcie_rc_initialize_config_space(int pcie_port)
        pciercx_cfg006.s.pbnum = 1;
        pciercx_cfg006.s.sbnum = 1;
        pciercx_cfg006.s.subbnum = 1;
-       cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG006(pcie_port),
-                            pciercx_cfg006.u32);
+       cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG006(pcie_port), pciercx_cfg006.u32);
+
 
        /*
         * Memory-mapped I/O BAR (PCIERCn_CFG008)
@@ -473,8 +522,8 @@ static void __cvmx_pcie_rc_initialize_config_space(int pcie_port)
        pciercx_cfg008.u32 = 0;
        pciercx_cfg008.s.mb_addr = 0x100;
        pciercx_cfg008.s.ml_addr = 0;
-       cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG008(pcie_port),
-                            pciercx_cfg008.u32);
+       cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG008(pcie_port), pciercx_cfg008.u32);
+
 
        /*
         * Prefetchable BAR (PCIERCn_CFG009,PCIERCn_CFG010,PCIERCn_CFG011)
@@ -482,72 +531,51 @@ static void __cvmx_pcie_rc_initialize_config_space(int pcie_port)
         * PCIERCn_CFG011[UMEM_LIMIT],PCIERCn_CFG009[LMEM_LIMIT] <
         * PCIERCn_CFG010[UMEM_BASE],PCIERCn_CFG009[LMEM_BASE]
         */
-       pciercx_cfg009.u32 =
-               cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG009(pcie_port));
-       pciercx_cfg010.u32 =
-               cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG010(pcie_port));
-       pciercx_cfg011.u32 =
-               cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG011(pcie_port));
+       pciercx_cfg009.u32 = cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG009(pcie_port));
+       pciercx_cfg010.u32 = cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG010(pcie_port));
+       pciercx_cfg011.u32 = cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG011(pcie_port));
        pciercx_cfg009.s.lmem_base = 0x100;
        pciercx_cfg009.s.lmem_limit = 0;
        pciercx_cfg010.s.umem_base = 0x100;
        pciercx_cfg011.s.umem_limit = 0;
-       cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG009(pcie_port),
-                            pciercx_cfg009.u32);
-       cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG010(pcie_port),
-                            pciercx_cfg010.u32);
-       cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG011(pcie_port),
-                            pciercx_cfg011.u32);
+       cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG009(pcie_port), pciercx_cfg009.u32);
+       cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG010(pcie_port), pciercx_cfg010.u32);
+       cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG011(pcie_port), pciercx_cfg011.u32);
 
        /*
         * System Error Interrupt Enables (PCIERCn_CFG035[SECEE,SEFEE,SENFEE])
         * PME Interrupt Enables (PCIERCn_CFG035[PMEIE])
-        */
-       pciercx_cfg035.u32 =
-               cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG035(pcie_port));
-       /* System error on correctable error enable. */
-       pciercx_cfg035.s.secee = 1;
-       /* System error on fatal error enable. */
-       pciercx_cfg035.s.sefee = 1;
-       /* System error on non-fatal error enable. */
-       pciercx_cfg035.s.senfee = 1;
-       /* PME interrupt enable. */
-       pciercx_cfg035.s.pmeie = 1;
-       cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG035(pcie_port),
-                            pciercx_cfg035.u32);
+       */
+       pciercx_cfg035.u32 = cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG035(pcie_port));
+       pciercx_cfg035.s.secee = 1; /* System error on correctable error enable. */
+       pciercx_cfg035.s.sefee = 1; /* System error on fatal error enable. */
+       pciercx_cfg035.s.senfee = 1; /* System error on non-fatal error enable. */
+       pciercx_cfg035.s.pmeie = 1; /* PME interrupt enable. */
+       cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG035(pcie_port), pciercx_cfg035.u32);
 
        /*
         * Advanced Error Recovery Interrupt Enables
         * (PCIERCn_CFG075[CERE,NFERE,FERE])
         */
-       pciercx_cfg075.u32 =
-               cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG075(pcie_port));
-       /* Correctable error reporting enable. */
-       pciercx_cfg075.s.cere = 1;
-       /* Non-fatal error reporting enable. */
-       pciercx_cfg075.s.nfere = 1;
-       /* Fatal error reporting enable. */
-       pciercx_cfg075.s.fere = 1;
-       cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG075(pcie_port),
-                            pciercx_cfg075.u32);
+       pciercx_cfg075.u32 = cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG075(pcie_port));
+       pciercx_cfg075.s.cere = 1; /* Correctable error reporting enable. */
+       pciercx_cfg075.s.nfere = 1; /* Non-fatal error reporting enable. */
+       pciercx_cfg075.s.fere = 1; /* Fatal error reporting enable. */
+       cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG075(pcie_port), pciercx_cfg075.u32);
 
-       /* HP Interrupt Enables (PCIERCn_CFG034[HPINT_EN],
+       /*
+        * HP Interrupt Enables (PCIERCn_CFG034[HPINT_EN],
         * PCIERCn_CFG034[DLLS_EN,CCINT_EN])
         */
-       pciercx_cfg034.u32 =
-               cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG034(pcie_port));
-       /* Hot-plug interrupt enable. */
-       pciercx_cfg034.s.hpint_en = 1;
-       /* Data Link Layer state changed enable */
-       pciercx_cfg034.s.dlls_en = 1;
-       /* Command completed interrupt enable. */
-       pciercx_cfg034.s.ccint_en = 1;
-       cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG034(pcie_port),
-                            pciercx_cfg034.u32);
+       pciercx_cfg034.u32 = cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG034(pcie_port));
+       pciercx_cfg034.s.hpint_en = 1; /* Hot-plug interrupt enable. */
+       pciercx_cfg034.s.dlls_en = 1; /* Data Link Layer state changed enable */
+       pciercx_cfg034.s.ccint_en = 1; /* Command completed interrupt enable. */
+       cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG034(pcie_port), pciercx_cfg034.u32);
 }
 
 /**
- * Initialize a host mode PCIe link. This function takes a PCIe
+ * Initialize a host mode PCIe gen 1 link. This function takes a PCIe
  * port from reset to a link up state. Software can then begin
  * configuring the rest of the link.
  *
@@ -555,7 +583,7 @@ static void __cvmx_pcie_rc_initialize_config_space(int pcie_port)
  *
  * Returns Zero on success
  */
-static int __cvmx_pcie_rc_initialize_link(int pcie_port)
+static int __cvmx_pcie_rc_initialize_link_gen1(int pcie_port)
 {
        uint64_t start_cycle;
        union cvmx_pescx_ctl_status pescx_ctl_status;
@@ -564,18 +592,15 @@ static int __cvmx_pcie_rc_initialize_link(int pcie_port)
        union cvmx_pciercx_cfg448 pciercx_cfg448;
 
        /* Set the lane width */
-       pciercx_cfg452.u32 =
-           cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG452(pcie_port));
+       pciercx_cfg452.u32 = cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG452(pcie_port));
        pescx_ctl_status.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_PESCX_CTL_STATUS(pcie_port));
-       if (pescx_ctl_status.s.qlm_cfg == 0) {
+       if (pescx_ctl_status.s.qlm_cfg == 0)
                /* We're in 8 lane (56XX) or 4 lane (54XX) mode */
                pciercx_cfg452.s.lme = 0xf;
-       } else {
+       else
                /* We're in 4 lane (56XX) or 2 lane (52XX) mode */
                pciercx_cfg452.s.lme = 0x7;
-       }
-       cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG452(pcie_port),
-                            pciercx_cfg452.u32);
+       cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG452(pcie_port), pciercx_cfg452.u32);
 
        /*
         * CN52XX pass 1.x has an errata where length mismatches on UR
@@ -584,19 +609,15 @@ static int __cvmx_pcie_rc_initialize_link(int pcie_port)
         */
        if (OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN52XX_PASS1_X)) {
                union cvmx_pciercx_cfg455 pciercx_cfg455;
-               pciercx_cfg455.u32 =
-                   cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port,
-                                       CVMX_PCIERCX_CFG455(pcie_port));
+               pciercx_cfg455.u32 = cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG455(pcie_port));
                pciercx_cfg455.s.m_cpl_len_err = 1;
-               cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG455(pcie_port),
-                                    pciercx_cfg455.u32);
+               cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG455(pcie_port), pciercx_cfg455.u32);
        }
 
        /* Lane swap needs to be manually enabled for CN52XX */
        if (OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN52XX) && (pcie_port == 1)) {
                pescx_ctl_status.s.lane_swp = 1;
-               cvmx_write_csr(CVMX_PESCX_CTL_STATUS(pcie_port),
-                              pescx_ctl_status.u64);
+               cvmx_write_csr(CVMX_PESCX_CTL_STATUS(pcie_port), pescx_ctl_status.u64);
        }
 
        /* Bring up the link */
@@ -612,24 +633,18 @@ static int __cvmx_pcie_rc_initialize_link(int pcie_port)
                __cvmx_helper_errata_qlm_disable_2nd_order_cdr(0);
 
        /* Wait for the link to come up */
-       cvmx_dprintf("PCIe: Waiting for port %d link\n", pcie_port);
        start_cycle = cvmx_get_cycle();
        do {
-               if (cvmx_get_cycle() - start_cycle >
-                   2 * cvmx_sysinfo_get()->cpu_clock_hz) {
-                       cvmx_dprintf("PCIe: Port %d link timeout\n",
-                                    pcie_port);
+               if (cvmx_get_cycle() - start_cycle > 2 * octeon_get_clock_rate()) {
+                       cvmx_dprintf("PCIe: Port %d link timeout\n", pcie_port);
                        return -1;
                }
                cvmx_wait(10000);
-               pciercx_cfg032.u32 =
-                   cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port,
-                                       CVMX_PCIERCX_CFG032(pcie_port));
+               pciercx_cfg032.u32 = cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG032(pcie_port));
        } while (pciercx_cfg032.s.dlla == 0);
 
-       /* Display the link status */
-       cvmx_dprintf("PCIe: Port %d link active, %d lanes\n", pcie_port,
-                    pciercx_cfg032.s.nlw);
+       /* Clear all pending errors */
+       cvmx_write_csr(CVMX_PEXP_NPEI_INT_SUM, cvmx_read_csr(CVMX_PEXP_NPEI_INT_SUM));
 
        /*
         * Update the Replay Time Limit. Empirically, some PCIe
@@ -639,8 +654,7 @@ static int __cvmx_pcie_rc_initialize_link(int pcie_port)
         * our actual 256 byte MPS. The numbers below are directly
         * from the PCIe spec table 3-4.
         */
-       pciercx_cfg448.u32 =
-           cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG448(pcie_port));
+       pciercx_cfg448.u32 = cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG448(pcie_port));
        switch (pciercx_cfg032.s.nlw) {
        case 1:         /* 1 lane */
                pciercx_cfg448.s.rtl = 1677;
@@ -655,21 +669,28 @@ static int __cvmx_pcie_rc_initialize_link(int pcie_port)
                pciercx_cfg448.s.rtl = 258;
                break;
        }
-       cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG448(pcie_port),
-                            pciercx_cfg448.u32);
+       cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG448(pcie_port), pciercx_cfg448.u32);
 
        return 0;
 }
 
+static void __cvmx_increment_ba(union cvmx_sli_mem_access_subidx *pmas)
+{
+       if (OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN68XX))
+               pmas->cn68xx.ba++;
+       else
+               pmas->cn63xx.ba++;
+}
+
 /**
- * Initialize a PCIe port for use in host(RC) mode. It doesn't
+ * Initialize a PCIe gen 1 port for use in host(RC) mode. It doesn't
  * enumerate the bus.
  *
  * @pcie_port: PCIe port to initialize
  *
  * Returns Zero on success
  */
-static int cvmx_pcie_rc_initialize(int pcie_port)
+static int __cvmx_pcie_rc_initialize_gen1(int pcie_port)
 {
        int i;
        int base;
@@ -682,16 +703,17 @@ static int cvmx_pcie_rc_initialize(int pcie_port)
        union cvmx_npei_mem_access_subidx mem_access_subid;
        union cvmx_npei_dbg_data npei_dbg_data;
        union cvmx_pescx_ctl_status2 pescx_ctl_status2;
+       union cvmx_pciercx_cfg032 pciercx_cfg032;
        union cvmx_npei_bar1_indexx bar1_index;
 
+retry:
        /*
         * Make sure we aren't trying to setup a target mode interface
         * in host mode.
         */
        npei_ctl_status.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_PEXP_NPEI_CTL_STATUS);
        if ((pcie_port == 0) && !npei_ctl_status.s.host_mode) {
-               cvmx_dprintf("PCIe: ERROR: cvmx_pcie_rc_initialize() called "
-                            "on port0, but port0 is not in host mode\n");
+               cvmx_dprintf("PCIe: Port %d in endpoint mode\n", pcie_port);
                return -1;
        }
 
@@ -702,9 +724,7 @@ static int cvmx_pcie_rc_initialize(int pcie_port)
        if (OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN52XX)) {
                npei_dbg_data.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_PEXP_NPEI_DBG_DATA);
                if ((pcie_port == 1) && npei_dbg_data.cn52xx.qlm0_link_width) {
-                       cvmx_dprintf("PCIe: ERROR: cvmx_pcie_rc_initialize() "
-                                    "called on port1, but port1 is "
-                                    "disabled\n");
+                       cvmx_dprintf("PCIe: ERROR: cvmx_pcie_rc_initialize() called on port1, but port1 is disabled\n");
                        return -1;
                }
        }
@@ -733,7 +753,7 @@ static int cvmx_pcie_rc_initialize(int pcie_port)
                 * the board. As a workaround for this bug, we bring
                 * both PCIe ports out of reset at the same time
                 * instead of on separate calls. So for port 0, we
-                * bring both out of reset and do nothing on port 1.
+                * bring both out of reset and do nothing on port 1
                 */
                if (pcie_port == 0) {
                        ciu_soft_prst.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_CIU_SOFT_PRST);
@@ -746,13 +766,10 @@ static int cvmx_pcie_rc_initialize(int pcie_port)
                        if (ciu_soft_prst.s.soft_prst == 0) {
                                /* Reset the ports */
                                ciu_soft_prst.s.soft_prst = 1;
-                               cvmx_write_csr(CVMX_CIU_SOFT_PRST,
-                                              ciu_soft_prst.u64);
-                               ciu_soft_prst.u64 =
-                                   cvmx_read_csr(CVMX_CIU_SOFT_PRST1);
+                               cvmx_write_csr(CVMX_CIU_SOFT_PRST, ciu_soft_prst.u64);
+                               ciu_soft_prst.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_CIU_SOFT_PRST1);
                                ciu_soft_prst.s.soft_prst = 1;
-                               cvmx_write_csr(CVMX_CIU_SOFT_PRST1,
-                                              ciu_soft_prst.u64);
+                               cvmx_write_csr(CVMX_CIU_SOFT_PRST1, ciu_soft_prst.u64);
                                /* Wait until pcie resets the ports. */
                                udelay(2000);
                        }
@@ -782,11 +799,9 @@ static int cvmx_pcie_rc_initialize(int pcie_port)
                        /* Reset the port */
                        ciu_soft_prst.s.soft_prst = 1;
                        if (pcie_port)
-                               cvmx_write_csr(CVMX_CIU_SOFT_PRST1,
-                                              ciu_soft_prst.u64);
+                               cvmx_write_csr(CVMX_CIU_SOFT_PRST1, ciu_soft_prst.u64);
                        else
-                               cvmx_write_csr(CVMX_CIU_SOFT_PRST,
-                                              ciu_soft_prst.u64);
+                               cvmx_write_csr(CVMX_CIU_SOFT_PRST, ciu_soft_prst.u64);
                        /* Wait until pcie resets the ports. */
                        udelay(2000);
                }
@@ -808,25 +823,21 @@ static int cvmx_pcie_rc_initialize(int pcie_port)
         */
        cvmx_wait(400000);
 
-       /* PESCX_BIST_STATUS2[PCLK_RUN] was missing on pass 1 of CN56XX and
-          CN52XX, so we only probe it on newer chips */
-       if (!OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN56XX_PASS1_X)
-           && !OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN52XX_PASS1_X)) {
+       /*
+        * PESCX_BIST_STATUS2[PCLK_RUN] was missing on pass 1 of
+        * CN56XX and CN52XX, so we only probe it on newer chips
+        */
+       if (!OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN56XX_PASS1_X) && !OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN52XX_PASS1_X)) {
                /* Clear PCLK_RUN so we can check if the clock is running */
-               pescx_ctl_status2.u64 =
-                   cvmx_read_csr(CVMX_PESCX_CTL_STATUS2(pcie_port));
+               pescx_ctl_status2.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_PESCX_CTL_STATUS2(pcie_port));
                pescx_ctl_status2.s.pclk_run = 1;
-               cvmx_write_csr(CVMX_PESCX_CTL_STATUS2(pcie_port),
-                              pescx_ctl_status2.u64);
-               /*
-                * Now that we cleared PCLK_RUN, wait for it to be set
-                * again telling us the clock is running.
+               cvmx_write_csr(CVMX_PESCX_CTL_STATUS2(pcie_port), pescx_ctl_status2.u64);
+               /* Now that we cleared PCLK_RUN, wait for it to be set
+                * again telling us the clock is running
                 */
                if (CVMX_WAIT_FOR_FIELD64(CVMX_PESCX_CTL_STATUS2(pcie_port),
-                                         union cvmx_pescx_ctl_status2,
-                                         pclk_run, ==, 1, 10000)) {
-                       cvmx_dprintf("PCIe: Port %d isn't clocked, skipping.\n",
-                                    pcie_port);
+                                         union cvmx_pescx_ctl_status2, pclk_run, ==, 1, 10000)) {
+                       cvmx_dprintf("PCIe: Port %d isn't clocked, skipping.\n", pcie_port);
                        return -1;
                }
        }
@@ -836,30 +847,26 @@ static int cvmx_pcie_rc_initialize(int pcie_port)
         * the board probably hasn't wired the clocks up and the
         * interface should be skipped.
         */
-       pescx_ctl_status2.u64 =
-           cvmx_read_csr(CVMX_PESCX_CTL_STATUS2(pcie_port));
+       pescx_ctl_status2.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_PESCX_CTL_STATUS2(pcie_port));
        if (pescx_ctl_status2.s.pcierst) {
-               cvmx_dprintf("PCIe: Port %d stuck in reset, skipping.\n",
-                            pcie_port);
+               cvmx_dprintf("PCIe: Port %d stuck in reset, skipping.\n", pcie_port);
                return -1;
        }
 
        /*
-        * Check BIST2 status. If any bits are set skip this interface. This
-        * is an attempt to catch PCIE-813 on pass 1 parts.
+        * Check BIST2 status. If any bits are set skip this
+        * interface. This is an attempt to catch PCIE-813 on pass 1
+        * parts.
         */
-       pescx_bist_status2.u64 =
-           cvmx_read_csr(CVMX_PESCX_BIST_STATUS2(pcie_port));
+       pescx_bist_status2.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_PESCX_BIST_STATUS2(pcie_port));
        if (pescx_bist_status2.u64) {
-               cvmx_dprintf("PCIe: Port %d BIST2 failed. Most likely this "
-                            "port isn't hooked up, skipping.\n",
+               cvmx_dprintf("PCIe: Port %d BIST2 failed. Most likely this port isn't hooked up, skipping.\n",
                             pcie_port);
                return -1;
        }
 
        /* Check BIST status */
-       pescx_bist_status.u64 =
-           cvmx_read_csr(CVMX_PESCX_BIST_STATUS(pcie_port));
+       pescx_bist_status.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_PESCX_BIST_STATUS(pcie_port));
        if (pescx_bist_status.u64)
                cvmx_dprintf("PCIe: BIST FAILED for port %d (0x%016llx)\n",
                             pcie_port, CAST64(pescx_bist_status.u64));
@@ -868,50 +875,37 @@ static int cvmx_pcie_rc_initialize(int pcie_port)
        __cvmx_pcie_rc_initialize_config_space(pcie_port);
 
        /* Bring the link up */
-       if (__cvmx_pcie_rc_initialize_link(pcie_port)) {
-               cvmx_dprintf
-                   ("PCIe: ERROR: cvmx_pcie_rc_initialize_link() failed\n");
+       if (__cvmx_pcie_rc_initialize_link_gen1(pcie_port)) {
+               cvmx_dprintf("PCIe: Failed to initialize port %d, probably the slot is empty\n",
+                            pcie_port);
                return -1;
        }
 
        /* Store merge control (NPEI_MEM_ACCESS_CTL[TIMER,MAX_WORD]) */
        npei_mem_access_ctl.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_PEXP_NPEI_MEM_ACCESS_CTL);
-       /* Allow 16 words to combine */
-       npei_mem_access_ctl.s.max_word = 0;
-       /* Wait up to 127 cycles for more data */
-       npei_mem_access_ctl.s.timer = 127;
+       npei_mem_access_ctl.s.max_word = 0;     /* Allow 16 words to combine */
+       npei_mem_access_ctl.s.timer = 127;      /* Wait up to 127 cycles for more data */
        cvmx_write_csr(CVMX_PEXP_NPEI_MEM_ACCESS_CTL, npei_mem_access_ctl.u64);
 
        /* Setup Mem access SubDIDs */
        mem_access_subid.u64 = 0;
-       /* Port the request is sent to. */
-       mem_access_subid.s.port = pcie_port;
-       /* Due to an errata on pass 1 chips, no merging is allowed. */
-       mem_access_subid.s.nmerge = 1;
-       /* Endian-swap for Reads. */
-       mem_access_subid.s.esr = 1;
-       /* Endian-swap for Writes. */
-       mem_access_subid.s.esw = 1;
-       /* No Snoop for Reads. */
-       mem_access_subid.s.nsr = 1;
-       /* No Snoop for Writes. */
-       mem_access_subid.s.nsw = 1;
-       /* Disable Relaxed Ordering for Reads. */
-       mem_access_subid.s.ror = 0;
-       /* Disable Relaxed Ordering for Writes. */
-       mem_access_subid.s.row = 0;
-       /* PCIe Address Bits <63:34>. */
-       mem_access_subid.s.ba = 0;
+       mem_access_subid.s.port = pcie_port; /* Port the request is sent to. */
+       mem_access_subid.s.nmerge = 1;  /* Due to an errata on pass 1 chips, no merging is allowed. */
+       mem_access_subid.s.esr = 1;     /* Endian-swap for Reads. */
+       mem_access_subid.s.esw = 1;     /* Endian-swap for Writes. */
+       mem_access_subid.s.nsr = 0;     /* Enable Snooping for Reads. Octeon doesn't care, but devices might want this more conservative setting */
+       mem_access_subid.s.nsw = 0;     /* Enable Snoop for Writes. */
+       mem_access_subid.s.ror = 0;     /* Disable Relaxed Ordering for Reads. */
+       mem_access_subid.s.row = 0;     /* Disable Relaxed Ordering for Writes. */
+       mem_access_subid.s.ba = 0;      /* PCIe Adddress Bits <63:34>. */
 
        /*
         * Setup mem access 12-15 for port 0, 16-19 for port 1,
         * supplying 36 bits of address space.
         */
        for (i = 12 + pcie_port * 4; i < 16 + pcie_port * 4; i++) {
-               cvmx_write_csr(CVMX_PEXP_NPEI_MEM_ACCESS_SUBIDX(i),
-                              mem_access_subid.u64);
-               /* Set each SUBID to extend the addressable range */
-               mem_access_subid.s.ba += 1;
+               cvmx_write_csr(CVMX_PEXP_NPEI_MEM_ACCESS_SUBIDX(i), mem_access_subid.u64);
+               mem_access_subid.s.ba += 1; /* Set each SUBID to extend the addressable range */
        }
 
        /*
@@ -927,7 +921,7 @@ static int cvmx_pcie_rc_initialize(int pcie_port)
        /* Set Octeon's BAR0 to decode 0-16KB. It overlaps with Bar2 */
        cvmx_write_csr(CVMX_PESCX_P2N_BAR0_START(pcie_port), 0);
 
-       /* BAR1 follows BAR2 with a gap. */
+       /* BAR1 follows BAR2 with a gap so it has the same address as for gen2. */
        cvmx_write_csr(CVMX_PESCX_P2N_BAR1_START(pcie_port), CVMX_PCIE_BAR1_RC_BASE);
 
        bar1_index.u32 = 0;
@@ -992,13 +986,473 @@ static int cvmx_pcie_rc_initialize(int pcie_port)
                npei_ctl_port.s.waitl_com = 0;
                cvmx_write_csr(CVMX_PEXP_NPEI_CTL_PORT0, npei_ctl_port.u64);
        }
+
+       /*
+        * Both pass 1 and pass 2 of CN52XX and CN56XX have an errata
+        * that causes TLP ordering to not be preserved after multiple
+        * PCIe port resets. This code detects this fault and corrects
+        * it by aligning the TLP counters properly. Another link
+        * reset is then performed. See PCIE-13340
+        */
+       if (OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN56XX_PASS2_X) ||
+           OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN52XX_PASS2_X) ||
+           OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN56XX_PASS1_X) ||
+           OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN52XX_PASS1_X)) {
+               union cvmx_npei_dbg_data dbg_data;
+               int old_in_fif_p_count;
+               int in_fif_p_count;
+               int out_p_count;
+               int in_p_offset = (OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN52XX_PASS1_X) || OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN56XX_PASS1_X)) ? 4 : 1;
+               int i;
+
+               /*
+                * Choose a write address of 1MB. It should be
+                * harmless as all bars haven't been setup.
+                */
+               uint64_t write_address = (cvmx_pcie_get_mem_base_address(pcie_port) + 0x100000) | (1ull<<63);
+
+               /*
+                * Make sure at least in_p_offset have been executed before we try and
+                * read in_fif_p_count
+                */
+               i = in_p_offset;
+               while (i--) {
+                       cvmx_write64_uint32(write_address, 0);
+                       cvmx_wait(10000);
+               }
+
+               /*
+                * Read the IN_FIF_P_COUNT from the debug
+                * select. IN_FIF_P_COUNT can be unstable sometimes so
+                * read it twice with a write between the reads.  This
+                * way we can tell the value is good as it will
+                * increment by one due to the write
+                */
+               cvmx_write_csr(CVMX_PEXP_NPEI_DBG_SELECT, (pcie_port) ? 0xd7fc : 0xcffc);
+               cvmx_read_csr(CVMX_PEXP_NPEI_DBG_SELECT);
+               do {
+                       dbg_data.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_PEXP_NPEI_DBG_DATA);
+                       old_in_fif_p_count = dbg_data.s.data & 0xff;
+                       cvmx_write64_uint32(write_address, 0);
+                       cvmx_wait(10000);
+                       dbg_data.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_PEXP_NPEI_DBG_DATA);
+                       in_fif_p_count = dbg_data.s.data & 0xff;
+               } while (in_fif_p_count != ((old_in_fif_p_count+1) & 0xff));
+
+               /* Update in_fif_p_count for it's offset with respect to out_p_count */
+               in_fif_p_count = (in_fif_p_count + in_p_offset) & 0xff;
+
+               /* Read the OUT_P_COUNT from the debug select */
+               cvmx_write_csr(CVMX_PEXP_NPEI_DBG_SELECT, (pcie_port) ? 0xd00f : 0xc80f);
+               cvmx_read_csr(CVMX_PEXP_NPEI_DBG_SELECT);
+               dbg_data.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_PEXP_NPEI_DBG_DATA);
+               out_p_count = (dbg_data.s.data>>1) & 0xff;
+
+               /* Check that the two counters are aligned */
+               if (out_p_count != in_fif_p_count) {
+                       cvmx_dprintf("PCIe: Port %d aligning TLP counters as workaround to maintain ordering\n", pcie_port);
+                       while (in_fif_p_count != 0) {
+                               cvmx_write64_uint32(write_address, 0);
+                               cvmx_wait(10000);
+                               in_fif_p_count = (in_fif_p_count + 1) & 0xff;
+                       }
+                       /*
+                        * The EBH5200 board swapped the PCIe reset
+                        * lines on the board. This means we must
+                        * bring both links down and up, which will
+                        * cause the PCIe0 to need alignment
+                        * again. Lots of messages will be displayed,
+                        * but everything should work
+                        */
+                       if ((cvmx_sysinfo_get()->board_type == CVMX_BOARD_TYPE_EBH5200) &&
+                               (pcie_port == 1))
+                               cvmx_pcie_rc_initialize(0);
+                       /* Rety bringing this port up */
+                       goto retry;
+               }
+       }
+
+       /* Display the link status */
+       pciercx_cfg032.u32 = cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG032(pcie_port));
+       cvmx_dprintf("PCIe: Port %d link active, %d lanes\n", pcie_port, pciercx_cfg032.s.nlw);
+
        return 0;
 }
 
+/**
+  * Initialize a host mode PCIe gen 2 link. This function takes a PCIe
+ * port from reset to a link up state. Software can then begin
+ * configuring the rest of the link.
+ *
+ * @pcie_port: PCIe port to initialize
+ *
+ * Return Zero on success.
+ */
+static int __cvmx_pcie_rc_initialize_link_gen2(int pcie_port)
+{
+       uint64_t start_cycle;
+       union cvmx_pemx_ctl_status pem_ctl_status;
+       union cvmx_pciercx_cfg032 pciercx_cfg032;
+       union cvmx_pciercx_cfg448 pciercx_cfg448;
 
-/* Above was cvmx-pcie.c, below original pcie.c */
+       /* Bring up the link */
+       pem_ctl_status.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_PEMX_CTL_STATUS(pcie_port));
+       pem_ctl_status.s.lnk_enb = 1;
+       cvmx_write_csr(CVMX_PEMX_CTL_STATUS(pcie_port), pem_ctl_status.u64);
+
+       /* Wait for the link to come up */
+       start_cycle = cvmx_get_cycle();
+       do {
+               if (cvmx_get_cycle() - start_cycle >  octeon_get_clock_rate())
+                       return -1;
+               cvmx_wait(10000);
+               pciercx_cfg032.u32 = cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG032(pcie_port));
+       } while ((pciercx_cfg032.s.dlla == 0) || (pciercx_cfg032.s.lt == 1));
+
+       /*
+        * Update the Replay Time Limit. Empirically, some PCIe
+        * devices take a little longer to respond than expected under
+        * load. As a workaround for this we configure the Replay Time
+        * Limit to the value expected for a 512 byte MPS instead of
+        * our actual 256 byte MPS. The numbers below are directly
+        * from the PCIe spec table 3-4
+        */
+       pciercx_cfg448.u32 = cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG448(pcie_port));
+       switch (pciercx_cfg032.s.nlw) {
+       case 1: /* 1 lane */
+               pciercx_cfg448.s.rtl = 1677;
+               break;
+       case 2: /* 2 lanes */
+               pciercx_cfg448.s.rtl = 867;
+               break;
+       case 4: /* 4 lanes */
+               pciercx_cfg448.s.rtl = 462;
+               break;
+       case 8: /* 8 lanes */
+               pciercx_cfg448.s.rtl = 258;
+               break;
+       }
+       cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG448(pcie_port), pciercx_cfg448.u32);
+
+       return 0;
+}
 
 
+/**
+ * Initialize a PCIe gen 2 port for use in host(RC) mode. It doesn't enumerate
+ * the bus.
+ *
+ * @pcie_port: PCIe port to initialize
+ *
+ * Returns Zero on success.
+ */
+static int __cvmx_pcie_rc_initialize_gen2(int pcie_port)
+{
+       int i;
+       union cvmx_ciu_soft_prst ciu_soft_prst;
+       union cvmx_mio_rst_ctlx mio_rst_ctl;
+       union cvmx_pemx_bar_ctl pemx_bar_ctl;
+       union cvmx_pemx_ctl_status pemx_ctl_status;
+       union cvmx_pemx_bist_status pemx_bist_status;
+       union cvmx_pemx_bist_status2 pemx_bist_status2;
+       union cvmx_pciercx_cfg032 pciercx_cfg032;
+       union cvmx_pciercx_cfg515 pciercx_cfg515;
+       union cvmx_sli_ctl_portx sli_ctl_portx;
+       union cvmx_sli_mem_access_ctl sli_mem_access_ctl;
+       union cvmx_sli_mem_access_subidx mem_access_subid;
+       union cvmx_sriox_status_reg sriox_status_reg;
+       union cvmx_pemx_bar1_indexx bar1_index;
+
+       if (octeon_has_feature(OCTEON_FEATURE_SRIO)) {
+               /* Make sure this interface isn't SRIO */
+               if (OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN66XX)) {
+                       /*
+                        * The CN66XX requires reading the
+                        * MIO_QLMX_CFG register to figure out the
+                        * port type.
+                        */
+                       union cvmx_mio_qlmx_cfg qlmx_cfg;
+                       qlmx_cfg.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_MIO_QLMX_CFG(pcie_port));
+
+                       if (qlmx_cfg.s.qlm_spd == 15) {
+                               pr_notice("PCIe: Port %d is disabled, skipping.\n", pcie_port);
+                               return -1;
+                       }
+
+                       switch (qlmx_cfg.s.qlm_spd) {
+                       case 0x1: /* SRIO 1x4 short */
+                       case 0x3: /* SRIO 1x4 long */
+                       case 0x4: /* SRIO 2x2 short */
+                       case 0x6: /* SRIO 2x2 long */
+                               pr_notice("PCIe: Port %d is SRIO, skipping.\n", pcie_port);
+                               return -1;
+                       case 0x9: /* SGMII */
+                               pr_notice("PCIe: Port %d is SGMII, skipping.\n", pcie_port);
+                               return -1;
+                       case 0xb: /* XAUI */
+                               pr_notice("PCIe: Port %d is XAUI, skipping.\n", pcie_port);
+                               return -1;
+                       case 0x0: /* PCIE gen2 */
+                       case 0x8: /* PCIE gen2 (alias) */
+                       case 0x2: /* PCIE gen1 */
+                       case 0xa: /* PCIE gen1 (alias) */
+                               break;
+                       default:
+                               pr_notice("PCIe: Port %d is unknown, skipping.\n", pcie_port);
+                               return -1;
+                       }
+               } else {
+                       sriox_status_reg.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_SRIOX_STATUS_REG(pcie_port));
+                       if (sriox_status_reg.s.srio) {
+                               pr_notice("PCIe: Port %d is SRIO, skipping.\n", pcie_port);
+                               return -1;
+                       }
+               }
+       }
+
+#if 0
+    /* This code is so that the PCIe analyzer is able to see 63XX traffic */
+       pr_notice("PCIE : init for pcie analyzer.\n");
+       cvmx_helper_qlm_jtag_init();
+       cvmx_helper_qlm_jtag_shift_zeros(pcie_port, 85);
+       cvmx_helper_qlm_jtag_shift(pcie_port, 1, 1);
+       cvmx_helper_qlm_jtag_shift_zeros(pcie_port, 300-86);
+       cvmx_helper_qlm_jtag_shift_zeros(pcie_port, 85);
+       cvmx_helper_qlm_jtag_shift(pcie_port, 1, 1);
+       cvmx_helper_qlm_jtag_shift_zeros(pcie_port, 300-86);
+       cvmx_helper_qlm_jtag_shift_zeros(pcie_port, 85);
+       cvmx_helper_qlm_jtag_shift(pcie_port, 1, 1);
+       cvmx_helper_qlm_jtag_shift_zeros(pcie_port, 300-86);
+       cvmx_helper_qlm_jtag_shift_zeros(pcie_port, 85);
+       cvmx_helper_qlm_jtag_shift(pcie_port, 1, 1);
+       cvmx_helper_qlm_jtag_shift_zeros(pcie_port, 300-86);
+       cvmx_helper_qlm_jtag_update(pcie_port);
+#endif
+
+       /* Make sure we aren't trying to setup a target mode interface in host mode */
+       mio_rst_ctl.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_MIO_RST_CTLX(pcie_port));
+       if (!mio_rst_ctl.s.host_mode) {
+               pr_notice("PCIe: Port %d in endpoint mode.\n", pcie_port);
+               return -1;
+       }
+
+       /* CN63XX Pass 1.0 errata G-14395 requires the QLM De-emphasis be programmed */
+       if (OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN63XX_PASS1_0)) {
+               if (pcie_port) {
+                       union cvmx_ciu_qlm1 ciu_qlm;
+                       ciu_qlm.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_CIU_QLM1);
+                       ciu_qlm.s.txbypass = 1;
+                       ciu_qlm.s.txdeemph = 5;
+                       ciu_qlm.s.txmargin = 0x17;
+                       cvmx_write_csr(CVMX_CIU_QLM1, ciu_qlm.u64);
+               } else {
+                       union cvmx_ciu_qlm0 ciu_qlm;
+                       ciu_qlm.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_CIU_QLM0);
+                       ciu_qlm.s.txbypass = 1;
+                       ciu_qlm.s.txdeemph = 5;
+                       ciu_qlm.s.txmargin = 0x17;
+                       cvmx_write_csr(CVMX_CIU_QLM0, ciu_qlm.u64);
+               }
+       }
+       /* Bring the PCIe out of reset */
+       if (pcie_port)
+               ciu_soft_prst.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_CIU_SOFT_PRST1);
+       else
+               ciu_soft_prst.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_CIU_SOFT_PRST);
+       /*
+        * After a chip reset the PCIe will also be in reset. If it
+        * isn't, most likely someone is trying to init it again
+        * without a proper PCIe reset
+        */
+       if (ciu_soft_prst.s.soft_prst == 0) {
+               /* Reset the port */
+               ciu_soft_prst.s.soft_prst = 1;
+               if (pcie_port)
+                       cvmx_write_csr(CVMX_CIU_SOFT_PRST1, ciu_soft_prst.u64);
+               else
+                       cvmx_write_csr(CVMX_CIU_SOFT_PRST, ciu_soft_prst.u64);
+               /* Wait until pcie resets the ports. */
+               udelay(2000);
+       }
+       if (pcie_port) {
+               ciu_soft_prst.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_CIU_SOFT_PRST1);
+               ciu_soft_prst.s.soft_prst = 0;
+               cvmx_write_csr(CVMX_CIU_SOFT_PRST1, ciu_soft_prst.u64);
+       } else {
+               ciu_soft_prst.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_CIU_SOFT_PRST);
+               ciu_soft_prst.s.soft_prst = 0;
+               cvmx_write_csr(CVMX_CIU_SOFT_PRST, ciu_soft_prst.u64);
+       }
+
+       /* Wait for PCIe reset to complete */
+       udelay(1000);
+
+       /*
+        * Check and make sure PCIe came out of reset. If it doesn't
+        * the board probably hasn't wired the clocks up and the
+        * interface should be skipped.
+        */
+       if (CVMX_WAIT_FOR_FIELD64(CVMX_MIO_RST_CTLX(pcie_port), union cvmx_mio_rst_ctlx, rst_done, ==, 1, 10000)) {
+               pr_notice("PCIe: Port %d stuck in reset, skipping.\n", pcie_port);
+               return -1;
+       }
+
+       /* Check BIST status */
+       pemx_bist_status.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_PEMX_BIST_STATUS(pcie_port));
+       if (pemx_bist_status.u64)
+               pr_notice("PCIe: BIST FAILED for port %d (0x%016llx)\n", pcie_port, CAST64(pemx_bist_status.u64));
+       pemx_bist_status2.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_PEMX_BIST_STATUS2(pcie_port));
+       /* Errata PCIE-14766 may cause the lower 6 bits to be randomly set on CN63XXp1 */
+       if (OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN63XX_PASS1_X))
+               pemx_bist_status2.u64 &= ~0x3full;
+       if (pemx_bist_status2.u64)
+               pr_notice("PCIe: BIST2 FAILED for port %d (0x%016llx)\n", pcie_port, CAST64(pemx_bist_status2.u64));
+
+       /* Initialize the config space CSRs */
+       __cvmx_pcie_rc_initialize_config_space(pcie_port);
+
+       /* Enable gen2 speed selection */
+       pciercx_cfg515.u32 = cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG515(pcie_port));
+       pciercx_cfg515.s.dsc = 1;
+       cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG515(pcie_port), pciercx_cfg515.u32);
+
+       /* Bring the link up */
+       if (__cvmx_pcie_rc_initialize_link_gen2(pcie_port)) {
+               /*
+                * Some gen1 devices don't handle the gen 2 training
+                * correctly. Disable gen2 and try again with only
+                * gen1
+                */
+               union cvmx_pciercx_cfg031 pciercx_cfg031;
+               pciercx_cfg031.u32 = cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG031(pcie_port));
+               pciercx_cfg031.s.mls = 1;
+               cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG031(pcie_port), pciercx_cfg031.u32);
+               if (__cvmx_pcie_rc_initialize_link_gen2(pcie_port)) {
+                       pr_notice("PCIe: Link timeout on port %d, probably the slot is empty\n", pcie_port);
+                       return -1;
+               }
+       }
+
+       /* Store merge control (SLI_MEM_ACCESS_CTL[TIMER,MAX_WORD]) */
+       sli_mem_access_ctl.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_PEXP_SLI_MEM_ACCESS_CTL);
+       sli_mem_access_ctl.s.max_word = 0;      /* Allow 16 words to combine */
+       sli_mem_access_ctl.s.timer = 127;       /* Wait up to 127 cycles for more data */
+       cvmx_write_csr(CVMX_PEXP_SLI_MEM_ACCESS_CTL, sli_mem_access_ctl.u64);
+
+       /* Setup Mem access SubDIDs */
+       mem_access_subid.u64 = 0;
+       mem_access_subid.s.port = pcie_port; /* Port the request is sent to. */
+       mem_access_subid.s.nmerge = 0;  /* Allow merging as it works on CN6XXX. */
+       mem_access_subid.s.esr = 1;     /* Endian-swap for Reads. */
+       mem_access_subid.s.esw = 1;     /* Endian-swap for Writes. */
+       mem_access_subid.s.wtype = 0;   /* "No snoop" and "Relaxed ordering" are not set */
+       mem_access_subid.s.rtype = 0;   /* "No snoop" and "Relaxed ordering" are not set */
+       /* PCIe Adddress Bits <63:34>. */
+       if (OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN68XX))
+               mem_access_subid.cn68xx.ba = 0;
+       else
+               mem_access_subid.cn63xx.ba = 0;
+
+       /*
+        * Setup mem access 12-15 for port 0, 16-19 for port 1,
+        * supplying 36 bits of address space.
+        */
+       for (i = 12 + pcie_port * 4; i < 16 + pcie_port * 4; i++) {
+               cvmx_write_csr(CVMX_PEXP_SLI_MEM_ACCESS_SUBIDX(i), mem_access_subid.u64);
+               /* Set each SUBID to extend the addressable range */
+               __cvmx_increment_ba(&mem_access_subid);
+       }
+
+       /*
+        * Disable the peer to peer forwarding register. This must be
+        * setup by the OS after it enumerates the bus and assigns
+        * addresses to the PCIe busses.
+        */
+       for (i = 0; i < 4; i++) {
+               cvmx_write_csr(CVMX_PEMX_P2P_BARX_START(i, pcie_port), -1);
+               cvmx_write_csr(CVMX_PEMX_P2P_BARX_END(i, pcie_port), -1);
+       }
+
+       /* Set Octeon's BAR0 to decode 0-16KB. It overlaps with Bar2 */
+       cvmx_write_csr(CVMX_PEMX_P2N_BAR0_START(pcie_port), 0);
+
+       /*
+        * Set Octeon's BAR2 to decode 0-2^41. Bar0 and Bar1 take
+        * precedence where they overlap. It also overlaps with the
+        * device addresses, so make sure the peer to peer forwarding
+        * is set right.
+        */
+       cvmx_write_csr(CVMX_PEMX_P2N_BAR2_START(pcie_port), 0);
+
+       /*
+        * Setup BAR2 attributes
+        * Relaxed Ordering (NPEI_CTL_PORTn[PTLP_RO,CTLP_RO, WAIT_COM])
+        * - PTLP_RO,CTLP_RO should normally be set (except for debug).
+        * - WAIT_COM=0 will likely work for all applications.
+        * Load completion relaxed ordering (NPEI_CTL_PORTn[WAITL_COM])
+        */
+       pemx_bar_ctl.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_PEMX_BAR_CTL(pcie_port));
+       pemx_bar_ctl.s.bar1_siz = 3;  /* 256MB BAR1*/
+       pemx_bar_ctl.s.bar2_enb = 1;
+       pemx_bar_ctl.s.bar2_esx = 1;
+       pemx_bar_ctl.s.bar2_cax = 0;
+       cvmx_write_csr(CVMX_PEMX_BAR_CTL(pcie_port), pemx_bar_ctl.u64);
+       sli_ctl_portx.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_PEXP_SLI_CTL_PORTX(pcie_port));
+       sli_ctl_portx.s.ptlp_ro = 1;
+       sli_ctl_portx.s.ctlp_ro = 1;
+       sli_ctl_portx.s.wait_com = 0;
+       sli_ctl_portx.s.waitl_com = 0;
+       cvmx_write_csr(CVMX_PEXP_SLI_CTL_PORTX(pcie_port), sli_ctl_portx.u64);
+
+       /* BAR1 follows BAR2 */
+       cvmx_write_csr(CVMX_PEMX_P2N_BAR1_START(pcie_port), CVMX_PCIE_BAR1_RC_BASE);
+
+       bar1_index.u64 = 0;
+       bar1_index.s.addr_idx = (CVMX_PCIE_BAR1_PHYS_BASE >> 22);
+       bar1_index.s.ca = 1;       /* Not Cached */
+       bar1_index.s.end_swp = 1;  /* Endian Swap mode */
+       bar1_index.s.addr_v = 1;   /* Valid entry */
+
+       for (i = 0; i < 16; i++) {
+               cvmx_write_csr(CVMX_PEMX_BAR1_INDEXX(i, pcie_port), bar1_index.u64);
+               /* 256MB / 16 >> 22 == 4 */
+               bar1_index.s.addr_idx += (((1ull << 28) / 16ull) >> 22);
+       }
+
+       /*
+        * Allow config retries for 250ms. Count is based off the 5Ghz
+        * SERDES clock.
+        */
+       pemx_ctl_status.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_PEMX_CTL_STATUS(pcie_port));
+       pemx_ctl_status.s.cfg_rtry = 250 * 5000000 / 0x10000;
+       cvmx_write_csr(CVMX_PEMX_CTL_STATUS(pcie_port), pemx_ctl_status.u64);
+
+       /* Display the link status */
+       pciercx_cfg032.u32 = cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port, CVMX_PCIERCX_CFG032(pcie_port));
+       pr_notice("PCIe: Port %d link active, %d lanes, speed gen%d\n", pcie_port, pciercx_cfg032.s.nlw, pciercx_cfg032.s.ls);
+
+       return 0;
+}
+
+/**
+ * Initialize a PCIe port for use in host(RC) mode. It doesn't enumerate the bus.
+ *
+ * @pcie_port: PCIe port to initialize
+ *
+ * Returns Zero on success
+ */
+static int cvmx_pcie_rc_initialize(int pcie_port)
+{
+       int result;
+       if (octeon_has_feature(OCTEON_FEATURE_NPEI))
+               result = __cvmx_pcie_rc_initialize_gen1(pcie_port);
+       else
+               result = __cvmx_pcie_rc_initialize_gen2(pcie_port);
+       return result;
+}
+
+/* Above was cvmx-pcie.c, below original pcie.c */
+
 /**
  * Map a PCI device to the appropriate interrupt line
  *
@@ -1027,11 +1481,12 @@ int __init octeon_pcie_pcibios_map_irq(const struct pci_dev *dev,
                 */
                while (dev->bus && dev->bus->parent)
                        dev = to_pci_dev(dev->bus->bridge);
-               /* If the root bus is number 0 and the PEX 8114 is the
+               /*
+                * If the root bus is number 0 and the PEX 8114 is the
                 * root, assume we are behind the miswired bus. We
                 * need to correct the swizzle level by two. Yuck.
                 */
-               if ((dev->bus->number == 0) &&
+               if ((dev->bus->number == 1) &&
                    (dev->vendor == 0x10b5) && (dev->device == 0x8114)) {
                        /*
                         * The pin field is one based, not zero. We
@@ -1048,39 +1503,73 @@ int __init octeon_pcie_pcibios_map_irq(const struct pci_dev *dev,
        return pin - 1 + OCTEON_IRQ_PCI_INT0;
 }
 
-/**
+static  void set_cfg_read_retry(u32 retry_cnt)
+{
+       union cvmx_pemx_ctl_status pemx_ctl;
+       pemx_ctl.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_PEMX_CTL_STATUS(1));
+       pemx_ctl.s.cfg_rtry = retry_cnt;
+       cvmx_write_csr(CVMX_PEMX_CTL_STATUS(1), pemx_ctl.u64);
+}
+
+
+static u32 disable_cfg_read_retry(void)
+{
+       u32 retry_cnt;
+
+       union cvmx_pemx_ctl_status pemx_ctl;
+       pemx_ctl.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_PEMX_CTL_STATUS(1));
+       retry_cnt =  pemx_ctl.s.cfg_rtry;
+       pemx_ctl.s.cfg_rtry = 0;
+       cvmx_write_csr(CVMX_PEMX_CTL_STATUS(1), pemx_ctl.u64);
+       return retry_cnt;
+}
+
+static int is_cfg_retry(void)
+{
+       union cvmx_pemx_int_sum pemx_int_sum;
+       pemx_int_sum.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_PEMX_INT_SUM(1));
+       if (pemx_int_sum.s.crs_dr)
+               return 1;
+       return 0;
+}
+
+/*
  * Read a value from configuration space
  *
- * @bus:
- * @devfn:
- * @reg:
- * @size:
- * @val:
- * Returns
  */
-static inline int octeon_pcie_read_config(int pcie_port, struct pci_bus *bus,
-                                         unsigned int devfn, int reg, int size,
-                                         u32 *val)
+static int octeon_pcie_read_config(unsigned int pcie_port, struct pci_bus *bus,
+                                  unsigned int devfn, int reg, int size,
+                                  u32 *val)
 {
        union octeon_cvmemctl cvmmemctl;
        union octeon_cvmemctl cvmmemctl_save;
        int bus_number = bus->number;
+       int cfg_retry = 0;
+       int retry_cnt = 0;
+       int max_retry_cnt = 10;
+       u32 cfg_retry_cnt = 0;
 
+       cvmmemctl_save.u64 = 0;
+       BUG_ON(pcie_port >= ARRAY_SIZE(enable_pcie_bus_num_war));
        /*
         * For the top level bus make sure our hardware bus number
-        * matches the software one.
+        * matches the software one
         */
        if (bus->parent == NULL) {
-               union cvmx_pciercx_cfg006 pciercx_cfg006;
-               pciercx_cfg006.u32 = cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port,
-                       CVMX_PCIERCX_CFG006(pcie_port));
-               if (pciercx_cfg006.s.pbnum != bus_number) {
-                       pciercx_cfg006.s.pbnum = bus_number;
-                       pciercx_cfg006.s.sbnum = bus_number;
-                       pciercx_cfg006.s.subbnum = bus_number;
-                       cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port,
-                               CVMX_PCIERCX_CFG006(pcie_port),
-                               pciercx_cfg006.u32);
+               if (enable_pcie_bus_num_war[pcie_port])
+                       bus_number = 0;
+               else {
+                       union cvmx_pciercx_cfg006 pciercx_cfg006;
+                       pciercx_cfg006.u32 = cvmx_pcie_cfgx_read(pcie_port,
+                                            CVMX_PCIERCX_CFG006(pcie_port));
+                       if (pciercx_cfg006.s.pbnum != bus_number) {
+                               pciercx_cfg006.s.pbnum = bus_number;
+                               pciercx_cfg006.s.sbnum = bus_number;
+                               pciercx_cfg006.s.subbnum = bus_number;
+                               cvmx_pcie_cfgx_write(pcie_port,
+                                           CVMX_PCIERCX_CFG006(pcie_port),
+                                           pciercx_cfg006.u32);
+                       }
                }
        }
 
@@ -1116,29 +1605,52 @@ static inline int octeon_pcie_read_config(int pcie_port, struct pci_bus *bus,
                 */
 #if 1
                /* Use this option if you aren't using either slot */
-               if (bus_number == 1)
+               if (bus_number == 2)
                        return PCIBIOS_FUNC_NOT_SUPPORTED;
 #elif 0
                /*
                 * Use this option if you are using the first slot but
                 * not the second.
                 */
-               if ((bus_number == 1) && (devfn >> 3 != 2))
+               if ((bus_number == 2) && (devfn >> 3 != 2))
                        return PCIBIOS_FUNC_NOT_SUPPORTED;
 #elif 0
                /*
                 * Use this option if you are using the second slot
                 * but not the first.
                 */
-               if ((bus_number == 1) && (devfn >> 3 != 3))
+               if ((bus_number == 2) && (devfn >> 3 != 3))
                        return PCIBIOS_FUNC_NOT_SUPPORTED;
 #elif 0
                /* Use this opion if you are using both slots */
-               if ((bus_number == 1) &&
+               if ((bus_number == 2) &&
                    !((devfn == (2 << 3)) || (devfn == (3 << 3))))
                        return PCIBIOS_FUNC_NOT_SUPPORTED;
 #endif
 
+               /* The following #if gives a more complicated example. This is
+                  the required checks for running a Nitrox CN16XX-NHBX in the
+                  slot of the EBH5600. This card has a PLX PCIe bridge with
+                  four Nitrox PLX parts behind it */
+#if 0
+               /* PLX bridge with 4 ports */
+               if ((bus_number == 4) &&
+                   !((devfn >> 3 >= 1) && (devfn >> 3 <= 4)))
+                       return PCIBIOS_FUNC_NOT_SUPPORTED;
+               /* Nitrox behind PLX 1 */
+               if ((bus_number == 5) && (devfn >> 3 != 0))
+                       return PCIBIOS_FUNC_NOT_SUPPORTED;
+               /* Nitrox behind PLX 2 */
+               if ((bus_number == 6) && (devfn >> 3 != 0))
+                       return PCIBIOS_FUNC_NOT_SUPPORTED;
+               /* Nitrox behind PLX 3 */
+               if ((bus_number == 7) && (devfn >> 3 != 0))
+                       return PCIBIOS_FUNC_NOT_SUPPORTED;
+               /* Nitrox behind PLX 4 */
+               if ((bus_number == 8) && (devfn >> 3 != 0))
+                       return PCIBIOS_FUNC_NOT_SUPPORTED;
+#endif
+
                /*
                 * Shorten the DID timeout so bus errors for PCIe
                 * config reads from non existent devices happen
@@ -1152,26 +1664,48 @@ static inline int octeon_pcie_read_config(int pcie_port, struct pci_bus *bus,
                __write_64bit_c0_register($11, 7, cvmmemctl.u64);
        }
 
-       switch (size) {
-       case 4:
-               *val = cvmx_pcie_config_read32(pcie_port, bus_number,
-                                              devfn >> 3, devfn & 0x7, reg);
+       if ((OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN63XX)) && (enable_pcie_14459_war))
+               cfg_retry_cnt = disable_cfg_read_retry();
+
+       pr_debug("pcie_cfg_rd port=%d b=%d devfn=0x%03x reg=0x%03x"
+                " size=%d ", pcie_port, bus_number, devfn, reg, size);
+       do {
+               switch (size) {
+               case 4:
+                       *val = cvmx_pcie_config_read32(pcie_port, bus_number,
+                               devfn >> 3, devfn & 0x7, reg);
                break;
-       case 2:
-               *val = cvmx_pcie_config_read16(pcie_port, bus_number,
-                                              devfn >> 3, devfn & 0x7, reg);
+               case 2:
+                       *val = cvmx_pcie_config_read16(pcie_port, bus_number,
+                               devfn >> 3, devfn & 0x7, reg);
                break;
-       case 1:
-               *val = cvmx_pcie_config_read8(pcie_port, bus_number, devfn >> 3,
-                                             devfn & 0x7, reg);
+               case 1:
+                       *val = cvmx_pcie_config_read8(pcie_port, bus_number,
+                               devfn >> 3, devfn & 0x7, reg);
                break;
-       default:
-               return PCIBIOS_FUNC_NOT_SUPPORTED;
-       }
+               default:
+                       if (OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN63XX))
+                               set_cfg_read_retry(cfg_retry_cnt);
+                       return PCIBIOS_FUNC_NOT_SUPPORTED;
+               }
+               if ((OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN63XX)) &&
+                       (enable_pcie_14459_war)) {
+                       cfg_retry = is_cfg_retry();
+                       retry_cnt++;
+                       if (retry_cnt > max_retry_cnt) {
+                               pr_err(" pcie cfg_read retries failed. retry_cnt=%d\n",
+                                      retry_cnt);
+                               cfg_retry = 0;
+                       }
+               }
+       } while (cfg_retry);
 
+       if ((OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN63XX)) && (enable_pcie_14459_war))
+               set_cfg_read_retry(cfg_retry_cnt);
+       pr_debug("val=%08x  : tries=%02d\n", *val, retry_cnt);
        if (OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN56XX_PASS1) ||
            OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN56XX_PASS1_1))
-               __write_64bit_c0_register($11, 7, cvmmemctl_save.u64);
+               write_c0_cvmmemctl(cvmmemctl_save.u64);
        return PCIBIOS_SUCCESSFUL;
 }
 
@@ -1187,42 +1721,56 @@ static int octeon_pcie1_read_config(struct pci_bus *bus, unsigned int devfn,
        return octeon_pcie_read_config(1, bus, devfn, reg, size, val);
 }
 
+static int octeon_dummy_read_config(struct pci_bus *bus, unsigned int devfn,
+                                   int reg, int size, u32 *val)
+{
+       return PCIBIOS_FUNC_NOT_SUPPORTED;
+}
 
-
-/**
+/*
  * Write a value to PCI configuration space
- *
- * @bus:
- * @devfn:
- * @reg:
- * @size:
- * @val:
- * Returns
  */
-static inline int octeon_pcie_write_config(int pcie_port, struct pci_bus *bus,
-                                          unsigned int devfn, int reg,
-                                          int size, u32 val)
+static int octeon_pcie_write_config(unsigned int pcie_port, struct pci_bus *bus,
+                                   unsigned int devfn, int reg,
+                                   int size, u32 val)
 {
        int bus_number = bus->number;
 
+       BUG_ON(pcie_port >= ARRAY_SIZE(enable_pcie_bus_num_war));
+
+       if ((bus->parent == NULL) && (enable_pcie_bus_num_war[pcie_port]))
+               bus_number = 0;
+
+       pr_debug("pcie_cfg_wr port=%d b=%d devfn=0x%03x"
+                " reg=0x%03x size=%d val=%08x\n", pcie_port, bus_number, devfn,
+                reg, size, val);
+
+
        switch (size) {
        case 4:
                cvmx_pcie_config_write32(pcie_port, bus_number, devfn >> 3,
                                         devfn & 0x7, reg, val);
-               return PCIBIOS_SUCCESSFUL;
+               break;
        case 2:
                cvmx_pcie_config_write16(pcie_port, bus_number, devfn >> 3,
                                         devfn & 0x7, reg, val);
-               return PCIBIOS_SUCCESSFUL;
+               break;
        case 1:
                cvmx_pcie_config_write8(pcie_port, bus_number, devfn >> 3,
                                        devfn & 0x7, reg, val);
-               return PCIBIOS_SUCCESSFUL;
+               break;
+       default:
+               return PCIBIOS_FUNC_NOT_SUPPORTED;
        }
 #if PCI_CONFIG_SPACE_DELAY
+       /*
+        * Delay on writes so that devices have time to come up. Some
+        * bridges need this to allow time for the secondary busses to
+        * work
+        */
        udelay(PCI_CONFIG_SPACE_DELAY);
 #endif
-       return PCIBIOS_FUNC_NOT_SUPPORTED;
+       return PCIBIOS_SUCCESSFUL;
 }
 
 static int octeon_pcie0_write_config(struct pci_bus *bus, unsigned int devfn,
@@ -1237,6 +1785,12 @@ static int octeon_pcie1_write_config(struct pci_bus *bus, unsigned int devfn,
        return octeon_pcie_write_config(1, bus, devfn, reg, size, val);
 }
 
+static int octeon_dummy_write_config(struct pci_bus *bus, unsigned int devfn,
+                                    int reg, int size, u32 val)
+{
+       return PCIBIOS_FUNC_NOT_SUPPORTED;
+}
+
 static struct pci_ops octeon_pcie0_ops = {
        octeon_pcie0_read_config,
        octeon_pcie0_write_config,
@@ -1279,6 +1833,35 @@ static struct pci_controller octeon_pcie1_controller = {
        .io_resource = &octeon_pcie1_io_resource,
 };
 
+static struct pci_ops octeon_dummy_ops = {
+       octeon_dummy_read_config,
+       octeon_dummy_write_config,
+};
+
+static struct resource octeon_dummy_mem_resource = {
+       .name = "Virtual PCIe MEM",
+       .flags = IORESOURCE_MEM,
+};
+
+static struct resource octeon_dummy_io_resource = {
+       .name = "Virtual PCIe IO",
+       .flags = IORESOURCE_IO,
+};
+
+static struct pci_controller octeon_dummy_controller = {
+       .pci_ops = &octeon_dummy_ops,
+       .mem_resource = &octeon_dummy_mem_resource,
+       .io_resource = &octeon_dummy_io_resource,
+};
+
+static int device_needs_bus_num_war(uint32_t deviceid)
+{
+#define IDT_VENDOR_ID 0x111d
+
+       if ((deviceid  & 0xffff) == IDT_VENDOR_ID)
+               return 1;
+       return 0;
+}
 
 /**
  * Initialize the Octeon PCIe controllers
@@ -1287,19 +1870,27 @@ static struct pci_controller octeon_pcie1_controller = {
  */
 static int __init octeon_pcie_setup(void)
 {
-       union cvmx_npei_ctl_status npei_ctl_status;
        int result;
+       int host_mode;
+       int srio_war15205 = 0, port;
+       union cvmx_sli_ctl_portx sli_ctl_portx;
+       union cvmx_sriox_status_reg sriox_status_reg;
 
        /* These chips don't have PCIe */
        if (!octeon_has_feature(OCTEON_FEATURE_PCIE))
                return 0;
 
+       /* No PCIe simulation */
+       if (octeon_is_simulation())
+               return 0;
+
+       /* Disable PCI if instructed on the command line */
+       if (pcie_disable)
+               return 0;
+
        /* Point pcibios_map_irq() to the PCIe version of it */
        octeon_pcibios_map_irq = octeon_pcie_pcibios_map_irq;
 
-       /* Use the PCIe based DMA mappings */
-       octeon_dma_bar_type = OCTEON_DMA_BAR_TYPE_PCIE;
-
        /*
         * PCIe I/O range. It is based on port 0 but includes up until
         * port 1's end.
@@ -1310,11 +1901,43 @@ static int __init octeon_pcie_setup(void)
                cvmx_pcie_get_io_base_address(1) -
                cvmx_pcie_get_io_base_address(0) + cvmx_pcie_get_io_size(1) - 1;
 
-       npei_ctl_status.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_PEXP_NPEI_CTL_STATUS);
-       if (npei_ctl_status.s.host_mode) {
+       /*
+        * Create a dummy PCIe controller to swallow up bus 0. IDT bridges
+        * don't work if the primary bus number is zero. Here we add a fake
+        * PCIe controller that the kernel will give bus 0. This allows
+        * us to not change the normal kernel bus enumeration
+        */
+       octeon_dummy_controller.io_map_base = -1;
+       octeon_dummy_controller.mem_resource->start = (1ull<<48);
+       octeon_dummy_controller.mem_resource->end = (1ull<<48);
+       register_pci_controller(&octeon_dummy_controller);
+
+       if (octeon_has_feature(OCTEON_FEATURE_NPEI)) {
+               union cvmx_npei_ctl_status npei_ctl_status;
+               npei_ctl_status.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_PEXP_NPEI_CTL_STATUS);
+               host_mode = npei_ctl_status.s.host_mode;
+               octeon_dma_bar_type = OCTEON_DMA_BAR_TYPE_PCIE;
+       } else {
+               union cvmx_mio_rst_ctlx mio_rst_ctl;
+               mio_rst_ctl.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_MIO_RST_CTLX(0));
+               host_mode = mio_rst_ctl.s.host_mode;
+               octeon_dma_bar_type = OCTEON_DMA_BAR_TYPE_PCIE2;
+       }
+
+       if (host_mode) {
                pr_notice("PCIe: Initializing port 0\n");
+               /* CN63XX pass 1_x/2.0 errata PCIe-15205 */
+               if (OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN63XX_PASS1_X) ||
+                       OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN63XX_PASS2_0)) {
+                       sriox_status_reg.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_SRIOX_STATUS_REG(0));
+                       if (sriox_status_reg.s.srio) {
+                               srio_war15205 += 1;      /* Port is SRIO */
+                               port = 0;
+                       }
+               }
                result = cvmx_pcie_rc_initialize(0);
                if (result == 0) {
+                       uint32_t device0;
                        /* Memory offsets are physical addresses */
                        octeon_pcie0_controller.mem_offset =
                                cvmx_pcie_get_mem_base_address(0);
@@ -1343,60 +1966,134 @@ static int __init octeon_pcie_setup(void)
                        octeon_pcie0_controller.io_resource->start = 4 << 10;
                        octeon_pcie0_controller.io_resource->end =
                                cvmx_pcie_get_io_size(0) - 1;
+                       msleep(100); /* Some devices need extra time */
                        register_pci_controller(&octeon_pcie0_controller);
+                       device0 = cvmx_pcie_config_read32(0, 0, 0, 0, 0);
+                       enable_pcie_bus_num_war[0] =
+                               device_needs_bus_num_war(device0);
                }
        } else {
                pr_notice("PCIe: Port 0 in endpoint mode, skipping.\n");
+               /* CN63XX pass 1_x/2.0 errata PCIe-15205 */
+               if (OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN63XX_PASS1_X) ||
+                       OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN63XX_PASS2_0)) {
+                       srio_war15205 += 1;
+                       port = 0;
+               }
        }
 
-       /* Skip the 2nd port on CN52XX if port 0 is in 4 lane mode */
-       if (OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN52XX)) {
-               union cvmx_npei_dbg_data npei_dbg_data;
-               npei_dbg_data.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_PEXP_NPEI_DBG_DATA);
-               if (npei_dbg_data.cn52xx.qlm0_link_width)
-                       return 0;
+       if (octeon_has_feature(OCTEON_FEATURE_NPEI)) {
+               host_mode = 1;
+               /* Skip the 2nd port on CN52XX if port 0 is in 4 lane mode */
+               if (OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN52XX)) {
+                       union cvmx_npei_dbg_data dbg_data;
+                       dbg_data.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_PEXP_NPEI_DBG_DATA);
+                       if (dbg_data.cn52xx.qlm0_link_width)
+                               host_mode = 0;
+               }
+       } else {
+               union cvmx_mio_rst_ctlx mio_rst_ctl;
+               mio_rst_ctl.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_MIO_RST_CTLX(1));
+               host_mode = mio_rst_ctl.s.host_mode;
        }
 
-       pr_notice("PCIe: Initializing port 1\n");
-       result = cvmx_pcie_rc_initialize(1);
-       if (result == 0) {
-               /* Memory offsets are physical addresses */
-               octeon_pcie1_controller.mem_offset =
-                       cvmx_pcie_get_mem_base_address(1);
-               /* IO offsets are Mips virtual addresses */
-               octeon_pcie1_controller.io_map_base =
-                       CVMX_ADD_IO_SEG(cvmx_pcie_get_io_base_address(1));
-               octeon_pcie1_controller.io_offset =
-                       cvmx_pcie_get_io_base_address(1) -
-                       cvmx_pcie_get_io_base_address(0);
-               /*
-                * To keep things similar to PCI, we start device
-                * addresses at the same place as PCI uisng big bar
-                * support. This normally translates to 4GB-256MB,
-                * which is the same as most x86 PCs.
-                */
-               octeon_pcie1_controller.mem_resource->start =
-                       cvmx_pcie_get_mem_base_address(1) + (4ul << 30) -
-                       (OCTEON_PCI_BAR1_HOLE_SIZE << 20);
-               octeon_pcie1_controller.mem_resource->end =
-                       cvmx_pcie_get_mem_base_address(1) +
-                       cvmx_pcie_get_mem_size(1) - 1;
-               /*
-                * Ports must be above 16KB for the ISA bus filtering
-                * in the PCI-X to PCI bridge.
-                */
-               octeon_pcie1_controller.io_resource->start =
-                       cvmx_pcie_get_io_base_address(1) -
-                       cvmx_pcie_get_io_base_address(0);
-               octeon_pcie1_controller.io_resource->end =
-                       octeon_pcie1_controller.io_resource->start +
-                       cvmx_pcie_get_io_size(1) - 1;
-               register_pci_controller(&octeon_pcie1_controller);
+       if (host_mode) {
+               pr_notice("PCIe: Initializing port 1\n");
+               /* CN63XX pass 1_x/2.0 errata PCIe-15205 */
+               if (OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN63XX_PASS1_X) ||
+                       OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN63XX_PASS2_0)) {
+                       sriox_status_reg.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_SRIOX_STATUS_REG(1));
+                       if (sriox_status_reg.s.srio) {
+                               srio_war15205 += 1;      /* Port is SRIO */
+                               port = 1;
+                       }
+               }
+               result = cvmx_pcie_rc_initialize(1);
+               if (result == 0) {
+                       uint32_t device0;
+                       /* Memory offsets are physical addresses */
+                       octeon_pcie1_controller.mem_offset =
+                               cvmx_pcie_get_mem_base_address(1);
+                       /*
+                        * To calculate the address for accessing the 2nd PCIe device,
+                        * either 'io_map_base' (pci_iomap()), or 'mips_io_port_base'
+                        * (ioport_map()) value is added to
+                        * pci_resource_start(dev,bar)). The 'mips_io_port_base' is set
+                        * only once based on first PCIe. Also changing 'io_map_base'
+                        * based on first slot's value so that both the routines will
+                        * work properly.
+                        */
+                       octeon_pcie1_controller.io_map_base =
+                               CVMX_ADD_IO_SEG(cvmx_pcie_get_io_base_address(0));
+                       /* IO offsets are Mips virtual addresses */
+                       octeon_pcie1_controller.io_offset =
+                               cvmx_pcie_get_io_base_address(1) -
+                               cvmx_pcie_get_io_base_address(0);
+                       /*
+                        * To keep things similar to PCI, we start device
+                        * addresses at the same place as PCI uisng big bar
+                        * support. This normally translates to 4GB-256MB,
+                        * which is the same as most x86 PCs.
+                        */
+                       octeon_pcie1_controller.mem_resource->start =
+                               cvmx_pcie_get_mem_base_address(1) + (4ul << 30) -
+                               (OCTEON_PCI_BAR1_HOLE_SIZE << 20);
+                       octeon_pcie1_controller.mem_resource->end =
+                               cvmx_pcie_get_mem_base_address(1) +
+                               cvmx_pcie_get_mem_size(1) - 1;
+                       /*
+                        * Ports must be above 16KB for the ISA bus filtering
+                        * in the PCI-X to PCI bridge.
+                        */
+                       octeon_pcie1_controller.io_resource->start =
+                               cvmx_pcie_get_io_base_address(1) -
+                               cvmx_pcie_get_io_base_address(0);
+                       octeon_pcie1_controller.io_resource->end =
+                               octeon_pcie1_controller.io_resource->start +
+                               cvmx_pcie_get_io_size(1) - 1;
+                       msleep(100); /* Some devices need extra time */
+                       register_pci_controller(&octeon_pcie1_controller);
+                       device0 = cvmx_pcie_config_read32(1, 0, 0, 0, 0);
+                       enable_pcie_bus_num_war[1] =
+                               device_needs_bus_num_war(device0);
+               }
+       } else {
+               pr_notice("PCIe: Port 1 not in root complex mode, skipping.\n");
+               /* CN63XX pass 1_x/2.0 errata PCIe-15205  */
+               if (OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN63XX_PASS1_X) ||
+                       OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN63XX_PASS2_0)) {
+                       srio_war15205 += 1;
+                       port = 1;
+               }
+       }
+
+       /*
+        * CN63XX pass 1_x/2.0 errata PCIe-15205 requires setting all
+        * of SRIO MACs SLI_CTL_PORT*[INT*_MAP] to similar value and
+        * all of PCIe Macs SLI_CTL_PORT*[INT*_MAP] to different value
+        * from the previous set values
+        */
+       if (OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN63XX_PASS1_X) ||
+               OCTEON_IS_MODEL(OCTEON_CN63XX_PASS2_0)) {
+               if (srio_war15205 == 1) {
+                       sli_ctl_portx.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_PEXP_SLI_CTL_PORTX(port));
+                       sli_ctl_portx.s.inta_map = 1;
+                       sli_ctl_portx.s.intb_map = 1;
+                       sli_ctl_portx.s.intc_map = 1;
+                       sli_ctl_portx.s.intd_map = 1;
+                       cvmx_write_csr(CVMX_PEXP_SLI_CTL_PORTX(port), sli_ctl_portx.u64);
+
+                       sli_ctl_portx.u64 = cvmx_read_csr(CVMX_PEXP_SLI_CTL_PORTX(!port));
+                       sli_ctl_portx.s.inta_map = 0;
+                       sli_ctl_portx.s.intb_map = 0;
+                       sli_ctl_portx.s.intc_map = 0;
+                       sli_ctl_portx.s.intd_map = 0;
+                       cvmx_write_csr(CVMX_PEXP_SLI_CTL_PORTX(!port), sli_ctl_portx.u64);
+               }
        }
 
        octeon_pci_dma_init();
 
        return 0;
 }
-
 arch_initcall(octeon_pcie_setup);